南京体育学院继续教育学院、培训中心、教练员学院（合署）前身为运动专修科，创办于1980年，主要为我省优秀运动队的运动员、教练员接受高等教育而开设。1997年，学校开始面向社会招收成人高等学历教育学生。1998年，学校成立南京体育学院成人教育办公室，与南京体育学院培训中心合署办公。2019年，学校机构改革，正式成立继续教育学院（培训中心），下设办公室、学历教育部、培训项目部三个科室。2021年，为进一步加强竞技体育教练员培训工作，学校成立南京体育学院教练员学院，挂靠继续教育学院（培训中心）。2024年国家体育总局取消成人高等教育自主招生，同年我校暂停成人高等学历教育招生。
近年来，学院重点打造体教融合的非学历教育课程体系，逐步成为学校扩大社会服务面和社会影响力的窗口之一，业务范围包括：各级各类体育师资、各级各类教练员、体育管理干部类、社会体育服务类、体卫融合、体教融合、体旅融合以及满足社会需求的培训。学院依托学校学、训、研“三位一体”“体教融合典范”等办学优势，充分发挥学校现代化教学场馆、专业训练设施、体能康复和生化实验中心等优质资源优势，积极探索创新实效性课程，邀请校内外知名专家、教授和一线体育教育（训练）名师（名教），从教学理论、科学训练、科研方法等方面为学员提供解决实际问题能力的方法与手段，为参训学员提供优质的教学保障和后勤服务。学院先后被授予国家社会体育指导员培训基地、全国体育传统项目学校师资培训基地、国家体育总局各级各类教练员培训基地、全国运动处方师培训基地、江苏省体育教师培训基地。
学院积极拓宽培训渠道，承担完成教育部、体育总局、省教育厅、省体育局主办的多项培训均受到好评。除本省外，培训合作单位辐射华东、华北、华南、西南、西北地区，先后有浙江、福建、广东、广西、内蒙古、江西、新疆、西藏、宁夏等地体育局（教育局）来我校进行研学、培训，促进了不同地区体育教育、竞技体育及群众体育事业的发展与交流。
面向未来，学院坚持内涵式高质量发展理念，不断强化核心竞争力建设，积极进行精品课程建设，努力提升教学保障能力，秉持创新、开放、融合和高质量发展理念，为“特色鲜明、走在前列”的高水平体育大学建设，为健康中国和体育强国建设作出新的贡献。